У Сектору за управљање отпадом и отпадним водама обављају се послови који се односе на: праћење и анализирање прописа ЕУ у области управљања отпадом и отпадним водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима; израде докумената ради усаглашавања националног законодавства у области управљања отпадом, отпадним водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима са ЕУ прописима; анализирање постојећих директива ЕУ, рад и учешће у раду приликом преношења директива у национално законодавство у области управљања отпадом, отпадним водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима; припрему стручних основа за израду прописа и непосредно учешће у изради прописа из делокруга рада Сектора; координацију активности на припреми, организовању и праћењу процеса израде и реализације стратегија, програма и планова у области заштите животне средине и управљања отпадом, отпадним водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима; утврђивање, координирање и развој циљева животне средине у области управљања отпадом, отпадним водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима; успостављање и развој система управљања комуналним, биоразградивим и индустријским отпадом и сарадња са јединицама локалне самоуправе у погледу усаглашавања праксе и примене закона; праћење и учешће у хармонизацији националних прописа са прописима Европске уније у области управљања отпадом у оквиру прекограничног кретања отпада, издавања дозвола за управљање отпадом и дозвола за управљање посебним токовима отпада, као и планирања управљања отпадом; учешће у изради стратешких докумената, истраживачких и других планова и програма у области одрживог коришћења, очувања квалитета површинских и подземних вода, заштите вода од загађивања и управљања отпадним водама, њиховом усаглашавању са стратешким документима у области заштите животне средине и дефинисању циљева животне средине у погледу површинских и подземних вода и заштићених области, као и праћење реализације тих стратегија, планова и програма; утврђивање стандарда квалитета животне средине за површинске воде, подземне воде и седимент, параметара еколошког и хемијског статуса површинских вода, као и квантитативног и хемијског статуса подземних вода и класификације вода; одређивање рањивих и осетљивих подручја, као и заштићених области на водном подручју; припрему и предлагање мониторинга статуса површинских и подземних вода; контролу уношења и испуштања у површинске воде, подземне воде и јавну канализацију отпадних вода, успостављање мерења количина и испитивање квалитета отпадних вода пре и после њиховог пречишћавања; сарадња са другим државним органима и институцијама у остваривању политике заштите животне средине у области управљања отпадом, водама, земљиштем, хемикалијама и биоцидним производима; учешће у раду Преговарачке групе за Поглавље 27, раду секторских радних група и обавеза из преговарачке позиције; учешће у процесима који су у вези са стручним усавршавањем државних службеника и друге послове у овој области.
У Сектору за управљање отпадом и отпадним водама образују се уже унутрашње јединице:
- Група за координацију усаглашавања правних прописа ЕУ у области управљања отпадом и отпадним водама
- Група за заштиту земљишта, санацију и ремедијацију
- Одељење за управљање отпадом
- Одељење за заштиту вода од загађивања
- Одељење за хемикалије
Информативни пулт за хемикалије и биоцидне производе