У Сектору за планирање и спровођење инфраструктурних пројеката у области заштите животне средине обављају се послови који се односе на: планирање и припрему пројеката, као и њихово спровођење и праћење спровођења пројеката и уговора у области заштите животне средине а нарочито у области отпада успостављањем региопналних центара за управљање отпадом, побољшања квалитета ваздуха заменом котлова, отпадних вода (изградњом или реконструкцијом постројења за пречишћавање отпадних вода и изградњом нове или реконструкцијом постојеће канализационе мреже) и воде за пиће (изградњом или реконструкцијом постројења за пречишћавање воде за пиће и водоводне мреже), финансираних из средстава донаторске међународне помоћи и/или међународних финансијских институција (ЕБРД, ЦЕБ, АФД, КФВ и сл.); припрему неопходне документације којом се обезбеђује финансирање из међународних извора ради усаглашавања међународних и домаћих прописа релевантних за имплементацију програма и пројеката; припрему и предлагање пројеката у складу са релевантном процедуром утврђеном од стране међународне организације и/или финансијске институције; учествовање у спровођење међународних јавних набавки у складу са релевантном процедуром утврђеном од стране међународне организације и/или финансијске институције; идентификовање и координирање припреме пројектне документације и друге документације потребне за спровођење инфраструктурних пројеката; спровођење пројеката, извршавање уговора и праћење послова техничког надзора над њиховим спровођењем; вођење и припрема документације ради спровођења поступка јавних набавки у складу са домаћим законодавством; сарадњу са донаторима, међународним организацијама, државним органима и институцијама, локалном самоуправом и другим заинтересованим странама у поступку израде и реализације пројеката, стратегија, планова и програма; организовање активности од значаја за јавност и видљивост пројеката финансираних из средстава донаторске међународне помоћи и/или међународних финансијских институција; припремање извештаја међународним донаторима и осталим финансијским институцијама које обезбеђују финансирање пројекта; организацију и координацију активности учесника у пројектима (локална комунална предузећа, јединице локалне самоуправе, међународне развојне и финансијске организације и др); учешће у процесима који су у вези са стручним усавршавањем државних службеника и друге послове из ове области.
У Сектору за планирање и спровођење инфраструктурних пројеката у области заштите животне средине образују се следеће уже унутрашње јединице:
1. Одељење за управљање пројектима у области отпада и побољшања квалитета ваздуха
2. Одељење за управљање пројектима у области отпадних вода и воде за пиће