U Sektoru za planiranje i sprovođenje infrastrukturnih projekata u oblasti zaštite životne sredine obavljaju se poslovi koji se odnose na: planiranje i pripremu projekata, kao i njihovo sprovođenje i praćenje sprovođenja projekata i ugovora u oblasti zaštite životne sredine a naročito u oblasti otpada uspostavljanjem regiopnalnih centara za upravljanje otpadom, poboljšanja kvaliteta vazduha zamenom kotlova, otpadnih voda (izgradnjom ili rekonstrukcijom postrojenja za prečišćavanje otpadnih voda i izgradnjom nove ili rekonstrukcijom postojeće kanalizacione mreže) i vode za piće (izgradnjom ili rekonstrukcijom postrojenja za prečišćavanje vode za piće i vodovodne mreže), finansiranih iz sredstava donatorske međunarodne pomoći i/ili međunarodnih finansijskih institucija (EBRD, CEB, AFD, KFV i sl.); pripremu neophodne dokumentacije kojom se obezbeđuje finansiranje iz međunarodnih izvora radi usaglašavanja međunarodnih i domaćih propisa relevantnih za implementaciju programa i projekata; pripremu i predlaganje projekata u skladu sa relevantnom procedurom utvrđenom od strane međunarodne organizacije i/ili finansijske institucije; učestvovanje u sprovođenje međunarodnih javnih nabavki u skladu sa relevantnom procedurom utvrđenom od strane međunarodne organizacije i/ili finansijske institucije; identifikovanje i koordiniranje pripreme projektne dokumentacije i druge dokumentacije potrebne za sprovođenje infrastrukturnih projekata; sprovođenje projekata, izvršavanje ugovora i praćenje poslova tehničkog nadzora nad njihovim sprovođenjem; vođenje i priprema dokumentacije radi sprovođenja postupka javnih nabavki u skladu sa domaćim zakonodavstvom; saradnju sa donatorima, međunarodnim organizacijama, državnim organima i institucijama, lokalnom samoupravom i drugim zainteresovanim stranama u postupku izrade i realizacije projekata, strategija, planova i programa; organizovanje aktivnosti od značaja za javnost i vidljivost projekata finansiranih iz sredstava donatorske međunarodne pomoći i/ili međunarodnih finansijskih institucija; pripremanje izveštaja međunarodnim donatorima i ostalim finansijskim institucijama koje obezbeđuju finansiranje projekta; organizaciju i koordinaciju aktivnosti učesnika u projektima (lokalna komunalna preduzeća, jedinice lokalne samouprave, međunarodne razvojne i finansijske organizacije i dr); učešće u procesima koji su u vezi sa stručnim usavršavanjem državnih službenika i druge poslove iz ove oblasti.
U Sektoru za planiranje i sprovođenje infrastrukturnih projekata u oblasti zaštite životne sredine obrazuju se sledeće uže unutrašnje jedinice:
1. Odeljenje za upravljanje projektima u oblasti otpada i poboljšanja kvaliteta vazduha
2. Odeljenje za upravljanje projektima u oblasti otpadnih voda i vode za piće