U Sekretarijatu Ministarstva obavljaju se poslovi od zajedničkog interesa za Ministarstvo koji se odnose na: kadrovske, informatičke, opšte i pravne poslove, analizu radnih mesta, usklađivanje rada unutrašnjih jedinica, saradnju sa drugim organima; pripremu predloga godišnjeg plana javnih nabavki i plana nabavki za ministarstvo u skladu sa finansijskim planom ministarstva; planiranje dinamike sprovođenja javnih nabavki u zavisnosti od obima i dinamike pristizanja zahteva organizacionih jedinica u skladu sa odobrenim sredstvima u budžetu ministarstva za te namene; obradu konkursne dokumentacije; pravni poslovi u vezi sa javnim nabavkama; poslovi koji se odnose na rukovanje tajnim podacima; pravni poslovi na izradi pravilnika i procedura rada za poslovne procese u ministarstvu, nabavku osnovnih sredstava, opreme i kancelarijskog materijala; učešće u procesima koji su u vezi sa stručnim usavršavanjem državnih službenika, kao i drugi poslovi iz delokruga Sekretarijata.
U Sekretarijatu Ministarstva obrazuju se sledeće uže unutrašnje jedinice:
1. Odeljenje za pravne, kadrovske i opšte poslove
2. Odeljenje za javne nabavke
3. Grupa za informacione tehnologije