U Sektoru za upravljanje životnom sredinom obavljaju se poslovi koji se odnose na: utvrđivanje, koordiniranje i razvoj ciljeva politike zaštite životne sredine; koordinaciju izrade i realizacije strategija, programa, planova i projekata u oblasti upravljanja životnom sredinom; praćenja preporuka, direktiva i drugih propisa evropskog zakonodavstva u oblasti upravljanja životnom sredinom; implementaciju međunarodnih konvencija, sporazuma, zakona i drugih propisa; utvrđivanje uslova zaštite životne sredine za izgradnju objekata i izvođenje radova kroz procenu uticaja na životnu sredinu; davanje mišljenja na odluke o izradi strateške procene uticaja, davanje saglasnosti na izveštaje o strateškoj proceni uticaja i davanje mišljenja za prostorne planove od republičkog značaja; primena Konvencije o proceni uticaja na životnu sredinu u prekograničnom kontekstu (ESPOO konvencija) i Protokola o strateškoj proceni uticaja (SEA protokol) pri sprovođenju prekograničnih konsultacija za projekte u proceduri primene zakona o proceni uticaja na životnu sredinu i strateškoj proceni uticaja; utvrđivanje uslova zaštite životne sredine od hemijskog udesa kroz pregled i davanje saglasnosti na Izveštaj o bezbednosti i Plan zaštite od udesa za seveso postrojenja; sprovođenje Konvencije o prekograničnim efektima industrijskih udesa; davanje mišljenja i utvrđivanje mera i uslova zaštite životne sredine od velikog hemijskog udesa za potrebe izrade prostornih i urbanističkih planova na svim nivoima, po zahtevu nosioca izrade plana; saradnja sa susednim državama u postupku obaveštavanja, odnosno razmeni podataka o seveso postrojenjima u prekograničnom kontekstu; praćenje razvoja najbolje dostupnih tehnika za potrebe integrisanog sprečavanja i kontrole zagađenja životne sredine; izdavanje integrisanih dozvola shodno Zakonu o integrisanom sprečavanju i kontroli zagađivanja životne sredine; zaštita od buke, vibracija i nejonizujućih zračenja; koordinacija i podrška nadležnim državnim organima i jedinica lokalne samouprave sa stanovišta zaštite životne sredine od dejstva štetnih organizama; koordinacija saradnje sa jedinicama lokalne samouprave u oblasti zaštite životne sredine, unapređenje rodne ravnopravnosti i jačanje uloge osetljivih društvenih grupa u sistemu zaštite životne sredine, koordinacija saradnje sa organizacijama civilnog društva u oblasti zaštite životne sredine; učešće u sprovođenju Konvencije o dostupnosti informacija, učešću javnosti u donošenju odluka i pravu na pravnu zaštitu u pitanjima životne sredine (Arhuska konvencija); učešće u procesima koji su u vezi sa stručnim usavršavanjem državnih službenika u Sektoru, saradnja sa naučnim i stručnim institucijama iz oblasti delokruga rada Sektora kao i dr. institucijama i organizacijama; i druge poslove iz ove oblasti.
U Sektoru za upravljanje životnom sredinom obrazuju se uže unutrašnje jedinice:
- Odsek za pravne poslove u oblasti upravljanja životnom sredinom
- Odeljenje za procenu uticaja na životnu sredinu
- Odeljenje za integrisane dozvole
- Odsek za zaštitu od velikog hemijskog udesa
- Odsek za zaštitu od buke, vibracija i nejonizujućih zračenja
- Grupa za zaštitu životne sredine od dejstva štetnih organizama
- Odsek za podršku jedinicama lokalne samouprave u oblasti zaštite životne sredine
- Odeljanje za saradnju sa civilnim društvom i unapređenje rodne ravnopravnosti u oblasti zaštite životne sredine