Za obavljanje poslova iz delokruga Ministarstva zaštite životne sredine obrazuju se sledeće
OSNOVNE UNUTRAŠNjE JEDINICE:
- Sektor za finansijsko upravljanje i kontrolu
- Sektor za upravljanje životnom sredinom
- Sektor za zaštitu prirode, vazduha i ozonskog omotača
- Sektor za međunarodnu saradnju i klimatske promene
- Sektor za upravljanje otpadom i otpadnim vodama
- Sektor za nadzor i preventivno delovanje u životnoj sredini
- Sektor za planiranje i sprovođenje infrastrukturnih projekata u oblasti zaštite životne sredine
POSEBNE UNUTRAŠNjE JEDINICE
- Posebna unutrašnja jedinica - Sekretarijat Ministarstva
- Uže unutrašnje jedinice izvan sastava sektora: Odeljenje za normativne poslove, harmonizaciju propisa, upravne i upravno - nadzorne poslove u oblasti zaštite životne sredine i Grupa za internu reviziju
ORGANI UPRAVE
Organ uprave u sastavu Ministarstva je Agencija za zaštitu životne sredine